Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GREB1Q4ZG55 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms