Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPROQ16827 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms