Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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ECM1Q16610 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
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ECM1Q16610 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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ECM1Q16610 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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ECM1Q16610 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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ECM1Q16610 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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ECM1Q16610 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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ECM1Q16610 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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ECM1Q16610 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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