Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACKR1Q16570 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms