Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CARTPTQ16568 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms