Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LY6EQ16553 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms