Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLFQ16534 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLFQ16534 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLFQ16534 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLFQ16534 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HLFQ16534 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLFQ16534 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLFQ16534 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLFQ16534 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLFQ16534 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLFQ16534 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLFQ16534 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLFQ16534 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HLFQ16534 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLFQ16534 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLFQ16534 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLFQ16534 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLFQ16534 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLFQ16534 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLFQ16534 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLFQ16534 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLFQ16534 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLFQ16534 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLFQ16534 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLFQ16534 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLFQ16534 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLFQ16534 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLFQ16534 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLFQ16534 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLFQ16534 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLFQ16534 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLFQ16534 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLFQ16534 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLFQ16534 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLFQ16534 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLFQ16534 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLFQ16534 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLFQ16534 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLFQ16534 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLFQ16534 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLFQ16534 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HLFQ16534 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLFQ16534 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLFQ16534 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLFQ16534 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms