Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD5Q16401 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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