Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EEA1Q15075 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
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