Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PCLAFQ15004 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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