Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLF9Q13886 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLF9Q13886 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLF9Q13886 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLF9Q13886 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLF9Q13886 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLF9Q13886 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLF9Q13886 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLF9Q13886 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLF9Q13886 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLF9Q13886 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLF9Q13886 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLF9Q13886 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLF9Q13886 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLF9Q13886 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLF9Q13886 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLF9Q13886 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLF9Q13886 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLF9Q13886 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLF9Q13886 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLF9Q13886 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLF9Q13886 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLF9Q13886 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLF9Q13886 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.05■□□□□ 0
KLF9Q13886 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLF9Q13886 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLF9Q13886 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLF9Q13886 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLF9Q13886 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms