Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPM6BQ13491 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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