Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP3B2Q13367 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AP3B2Q13367 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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