Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
STRN3Q13033 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms