Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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GRIK3Q13003 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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GRIK3Q13003 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK3Q13003 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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