Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF2Q12947 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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