Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms