Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNDQ07001 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms