Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5Q00535 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms