Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms