Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB1P98172 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms