Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL2P60520 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL2P60520 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL2P60520 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL2P60520 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL2P60520 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL2P60520 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL2P60520 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL2P60520 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL2P60520 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL2P60520 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms