Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms