Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL23P55773 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL23P55773 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL23P55773 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL23P55773 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL23P55773 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL23P55773 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL23P55773 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL23P55773 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL23P55773 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL23P55773 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL23P55773 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL23P55773 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL23P55773 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL23P55773 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL23P55773 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL23P55773 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL23P55773 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL23P55773 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL23P55773 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL23P55773 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL23P55773 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL23P55773 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL23P55773 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL23P55773 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL23P55773 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms