Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC1A2P43004 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC1A2P43004 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC1A2P43004 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms