Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA13P31271 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms