Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms