Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms