Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB3BP20337 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms