Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLR2CP19387 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms