Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPI1P17947 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPI1P17947 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPI1P17947 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPI1P17947 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPI1P17947 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPI1P17947 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms