Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms