Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ETFAP13804 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ETFAP13804 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ETFAP13804 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ETFAP13804 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ETFAP13804 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms