Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DOBP13765 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms