Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A1P12074 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A1P12074 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A1P12074 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A1P12074 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A1P12074 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A1P12074 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A1P12074 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A1P12074 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A1P12074 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A1P12074 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A1P12074 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A1P12074 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A1P12074 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A1P12074 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COX6A1P12074 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms