Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms