Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTA1P02549 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms