Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LTAP01374 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LTAP01374 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LTAP01374 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LTAP01374 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LTAP01374 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LTAP01374 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LTAP01374 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LTAP01374 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LTAP01374 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LTAP01374 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LTAP01374 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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LTAP01374 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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LTAP01374 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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LTAP01374 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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LTAP01374 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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LTAP01374 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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LTAP01374 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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LTAP01374 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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LTAP01374 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LTAP01374 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LTAP01374 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LTAP01374 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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LTAP01374 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LTAP01374 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LTAP01374 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LTAP01374 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LTAP01374 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LTAP01374 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LTAP01374 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LTAP01374 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LTAP01374 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LTAP01374 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LTAP01374 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LTAP01374 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LTAP01374 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LTAP01374 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LTAP01374 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LTAP01374 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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