Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HTRA2O43464 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms