Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARPC5O15511 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ARPC5O15511 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ARPC5O15511 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ARPC5O15511 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ARPC5O15511 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ARPC5O15511 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ARPC5O15511 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ARPC5O15511 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARPC5O15511 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARPC5O15511 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARPC5O15511 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARPC5O15511 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARPC5O15511 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms