Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EPHB6O15197 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EPHB6O15197 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms