Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BCKDKO14874 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BCKDKO14874 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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