Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms