Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
J3QR89 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
J3QR89 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
J3QR89 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
J3QR89 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
J3QR89 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
J3QR89 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
J3QR89 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
J3QR89 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
J3QR89 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
J3QR89 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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