Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM200CA6NKL6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM200CA6NKL6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms