Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD3L3A6NE82 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms