Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBNO2Q9Y2G9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms