Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms