Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVW-1Q9UQF0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVW-1Q9UQF0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms