Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DUX4Q9UBX2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms